El 21 de febrero de 1893 se creó la Asociación del Fútbol Argentino fundada por Alejandro Watson Hutton, un deportista y educador escocés nacionalizado en Argentina que ejerció el cargo como primer presidente de la AFA.

Por aquel entonces la institución no tenía el nombre por el que actualmente se la conoce, sino que recibió el título de Argentine Association Football League.

La AFA está dedicada a la organización y regulación de las diversas selecciones nacionales, y los campeonatos oficiales del deporte en el país. Además, incluye ramas como futsal, fútbol playa y femenino.

La AFA se encuentra afiliada a la FIFA (Fédération Internationale de Football Association) desde 1912 y a la Conmebol, de la que es miembro fundador, desde 1916.